为防止两淮动荡，朱翊钧下旨命操江御史何宽和应天巡抚都御史杨成分别带漕兵二千五百和南京守备兵三千，到杭州扎营，便于就近弹压。

随后又紧急起复被罢官的俞大猷为两淮巡盐提举，总理两淮盐丁事。负责安抚军心并操练巡盐兵丁，并剿灭闹事盐枭。

其实，朝廷大张旗鼓，雷霆一击，各大、小盐枭除非要反，谁敢作声？所谓的绿林好汉，粘上毛比猴都精，脑子进多少水才能给这些贪官污吏出头？个个偃旗息鼓，解散帮众，自家躲藏好才是正办。

锦衣卫随后抽调精干力量，继续深挖这些官员。朱翊钧始终在内宫掌着大局，每天要听一次“专案组”汇报。

他同时命锦衣卫在这些蠹虫身上多试验些审讯手段，进行数据分析整理，并尽快形成刑讯教材，大批量培训锦衣卫的刑讯高手。

到后来，盐商和官员也说不出新东西，但提供的证词都能作为佐证，终于给朱翊钧勾画出来以两淮盐司为核心的完整腐败网络，证据链条完整，各种旁证齐全。朱翊钧佯作大怒，将奏报发付廷议，命三法司会审。

等法司会审时，被锦衣卫折磨的灵魂升华，洗心革面的盐商和官员，个个争先恐后，你攀我咬，把大理寺众官惊得目瞪口呆。朱翊钧主政以来，真正意义上的大案——两淮余盐案，就从王琢玉的一本奏章上突破，震动朝野。

......

正可谓一波未平，一波又起，不过这后波因前波而来，直接把王琢玉、余懋学诏狱之事拍的无影无踪，到了七月末，朝野已无人关心两人死活。

百官所有精力都放在“两淮余盐案”上，四品以上包括御史科道官，每人手中一本活字印刷的《两淮余盐案官、商警示录》，内容触目惊心。

随着《警示录》的散布、传抄，里面的各种贿赂手段，让官场新嫩们大开眼界，心向往之。然而想想这么多的雅贿、俗贿、色贿、房地贿、贺喜贿、亲仆贿、典当贿、干股贿、借据贿、退休返利贿等等手段，都被拷掠的一干二净，众人都愁，如何开发新的贿种。