为此，工部特地从登莱调拨三艘巨舰，万料之躯，赐予辽东转运司，以资转运之需。然而，此等规模仍难承京城至辽东之浩大运输量。

鉴于此，度支司慷慨解囊，追加十万两白银作为辽东转运司之运营资本，以解燃眉之急。同时，鉴于物资转运人力之巨，兵部亦赋予辽东转运司部分调兵之权，以保运输顺畅。

杨嗣昌娓娓道来，朱由校闻之，颔首微笑，以示嘉许。“先帝遗训，辽饷押运，责任重于泰山，卿当慎之又慎。”言罢，他接过奏章，以天启之宝钤印其上，正式确认了这一新衙门的合法地位。

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“度支既已赐银十万，朕亦不甘人后，再添十万两，以资卿用。”朱由校慷慨陈词，杨嗣昌感激涕零，跪谢隆恩，双手接过奏章，如获至宝。

“卿可退下。”朱由校挥手示意，杨嗣昌心领神会，躬身告退，知皇帝欲与辅臣共商国事。

随后，朱由校引领三位辅臣至大堂，展示其精心制作的辽东、京畿沙盘，其上重点城市，一目了然。“朕意废卫设府，文武分治，以振辽东。”此言一出，满座皆惊，毕自严、徐光启、黄克瓒面面相觑，心中暗惊。

“辽东局势错综复杂，此举恐有碍前线战事。”毕自严率先发难。

“饭需一口口吃，路需一步步走。”朱由校从容不迫，以理服人，“辽东粮饷日增，边事频仍，犹如大明之流血创口，非堵不可。”

他继而谈及熊廷弼与建奴对峙，以及孙承宗屯田之策，指出宁远、广宁、海州、盖州四卫为屯田之佳选，而辽阳、沈阳则因前线战事紧张，不宜屯田。

徐光启则进一步分析，指出广宁、宁远周边虽有朵颜三部环伺，但大明与之互市多年，关系稳定；而盖、海、复、金、定辽右卫中，复、金两卫地处山区，不利屯田；定辽右卫则紧邻建州女真，亦非良选。他更以女真不善耕种、粮草匮乏为由，阐述了熊廷弼坚壁清野之策的成功之处，以及建奴因两次试探进攻辽沈未果而陷入困境的现状。

朱由校闻言，点头赞许，对徐光启的军事眼光深表认同。他最终拍板定案：“宁远、广宁、海、盖、复、金诸卫，废卫设府，势在必行！”