所以当时读书人是一个很大的群体，如果全部清理，大明至少一半人都要被牵连，这数量太大，即使有系统也不能这么做。

所以他采取的是温水煮青蛙，从教育等各个方面下手，反正他时间多，不怕人亡政息，在他的高压控制下，不说二十年，百年之后总能解决。

不过在这过程中，像这次的事肯定会发生，总有人看不清形势，妄想恢复到以前那种状态，朱由校也有心理准备。

“立刻开始大规模调查，你亲自到南京坐镇，一定要把这些人都抓出来！”

“臣遵旨！”

等郑耀先走后，朱由校又让人将魏忠贤叫来。

很快人就到了，这时候魏忠贤年龄也不小了，估计干不了多少年。

这些年他还挺老实，估计是被朱由校的狠辣手段吓到了，没做什么过分的举动。

将锦衣卫查到的情况给魏忠贤看了看，吓得他立刻跪在地上。

“皇爷可是有所吩咐？”

“起来吧，查案交给锦衣卫，你的任务就是盯着京城之前清洗留下的那些官员，还有这几年科举提拔的官员，朕要知道他们的一举一动。”

“是，奴婢遵旨！”

东厂的主要活动地点就是京城，之前各地的镇守太监已经被朱由校取消了。

当然地方监察也没放松，除了锦衣卫，朱由校扩大了都察院和六科给事中的规模。

其中都察院增加了巡查御史的规模，这些人常年在各地巡查，监督各地衙门。

而六科给事中除了原先六部的人，朱由校将他们下沉到省一级，规模也是扩大了。

不过为了限制这些监察官员，朱由校规定御史和六科给事中都只能在都察院升迁，同时将左都御史提高到了正二品，同时军机处里也有都察院的人。

而且朱由校废除了风闻奏事的规矩，下令凡是上奏必须言之有物，否则同罪论处。

而且为了限制监察人员和以前一样结党，朱由校规定，凡是都察院和六科人员参与党争，不论罪名大小，一旦发现，夷三族，这规矩直接写到了大明律里。

而且朱由校启用了清朝的密折制度，给予了不少人上密折的权利。